之后曾担任皇家马德里助理教练。
2001年他有些让人意外地成为接替了库珀,成为瓦伦西亚队的教练。球迷们一开始对他表示怀疑。但他接手第一个赛季就让瓦伦西亚三十一年再夺西甲冠军。2003年瓦伦西亚尽管在欧洲冠军杯中打进八强,但在西甲中只得第五,失去03-04欧洲冠军杯的参赛资格,不过在下一个赛季,贝尼特斯就再次带领瓦伦西亚夺得西甲和欧洲联盟杯。
2005年贝尼特斯率领利物浦在上半场落后三球的情况下连扳三球,最终夺得了04-05赛季欧洲冠军联赛冠军,这也就是记入史册的伊斯坦布尔奇迹之夜,那一场比赛也不知道让多少人都听到了心碎的声音,这其中自然也包括米兰的死忠张卫了,那一夜牙也是彻夜难眠,可贝尼特斯也成为继切尔西主帅穆里尼奥后,第二个在两个赛季里接连夺取欧洲联盟杯和欧洲冠军杯的现役教头。
2006年利物浦再次上演神奇逆转,击败西汉姆夺取了英格兰足总杯冠军,贝尼特斯和利物浦续约四年,他期待率领红军迈向更高峰,并向着阔别十九年的联赛冠军冲击,利物浦也希望在这位掌门人的带领下,重演当年香克利和佩斯利时代的辉煌。2009年利物浦本有希望拿到英超冠军,但是在强大的曼联让他们错过英超冠军,而之后贝尼特斯也逐渐成为了利物浦的替罪羊,最终也被人扔进了垃圾堆里,2010年贝尼特斯黯然离开了利物浦。
2010年6月6日国际米兰主席莫拉蒂在接受采访时表示,贝尼特斯将成为国际米兰的新任主教练,不过他在国际米兰的日子却过得很不好,只是半年之后国际米兰官方就宣布与主帅贝尼特斯解约,也黯然的离开了国际米兰。
当年国际米兰在官网上宣布“国际米兰和贝尼特斯通过协商,达成了一个双方都比较满意的协议,双方的合同将提前终止。国际米兰俱乐部感谢贝尼特斯,感谢他带领球队夺得了意大利超级杯冠军和世俱杯冠军。“
在夺得世俱杯之后贝尼特斯曾经向国际米兰发出最后通牒,表示如果莫拉蒂不在冬季买四名球员,他就选择走人,结果他的这番通牒并没有换来莫拉蒂的妥协,在结束了马德里的出差之后,莫拉蒂回到米兰召开高层会议,就决定解雇贝尼特斯。
时间2012年11月22日切尔西官方宣布确认聘请前利物浦主帅贝尼特斯作为球队的代理主帅,他的任期至12-13赛季末结束,俱乐部老板和董事层认为贝尼特斯具备丰富的执教顶级俱乐部的经验,他能够迅速融入球队并且帮助球队实现自己的目标。
贝尼特斯也兴奋地表示“我从上任第一天起就为胜利而战,没有人知道未来会发生什么。这个周末我们将迎来与曼城队的对决,我们还有五座奖杯要去争夺,“
此前切尔西老板阿布拉莫维奇已经在九年内解雇了七名知名主帅,而贝尼特斯也表示“我不确定阿布拉莫维奇想要什么风格,也不认为球队一定要遵循某一种特定的风格。只要我们取得了胜利,我想他会非常高兴的。“
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